自衛艦隊は、水上艦艇約８０隻、航空機約１９０機、潜水艦約２０隻を機動的に運用しています。これらの部隊は、主として「水上艦隊」、「航空集団」、「潜水艦隊」に所属しています。このほか、自衛艦隊には、「開発隊群」等の部隊を有しています。