航海員は、自衛艦（潜水艦を含む）に乗組み、手旗、発光、旗旒信号により自衛艦同士または商船とのメッセージ交換、並びに艦の操縦に関し操舵装置、航法装置の取り扱い、整備を行っています。
また、国旗の掲揚、降下時ラッパの吹奏を行います。