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体育科は、体育の実技及び理論の教務を担当しています。

水泳、球技、格技などを通じて海上自衛官として必要な強健な体力を練成し、健全な精神を育成しています。また、理論的・科学的な体力向上を図ることができるように、体育理論、指導法に関する知識面の教育も実施しています。

任務遂行のあらゆる場面で体力、気力が要求されるので、卒業後も継続的に体力向上を図っていく姿勢を大事にするよう指導しています。