明治３４年１０月に舞鶴鎮守府が設置され、その後第二次世界大戦の終わりまで海軍の基地として発展しました。

敗戦により昭和２０年１０月に海軍が廃止されました。 昭和２７年４月に保安庁警備隊が発足、同８月に舞鶴地方隊が新編され、 舞鶴地方総監部、舞鶴、新潟各航路啓開隊が置かれました。 昭和２９年７月防衛庁創設に伴い、海上警備隊は海上自衛隊となり現在に至ります。