崎辺分屯地は、佐世保市の中心から南へ約5Km佐世保市崎辺町に所在する。相浦駐屯地隷属の分屯地として2019年3月26日に開庁しました。
海上自衛隊佐世保基地崎辺地区に隣接し総面積約14万㎡の広さを誇ります。